王贻芳指出，当下，以竞争性项目制为核心的科研管理体制中，科学研究的一切组织事宜由政府的项目管理官员来控制，他们拥有立项、组织评审、审批等权力。这种管理体制相当于中央部委直接管理课题组，完全忽略或跳过了关键的中间层——科研单位。这与大多数国家的科研管理模式不太一样，没有充分发挥科研单位和专家的作用。“本质上其实是不相信科学家。”他说。

　　一边是陈水扁多次违规动用当局资源，引导公营企业和团体参与高铁增资入股；另一边是本应承担增资义务的五家原始股东企业赚得盆满钵满。有媒体统计，它们接到了相当于实际出资额三倍的分包工程。还有调查指，这五家净利可达数百亿新台币。

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　　据报道，20世纪90年代台湾筹建高铁的时候，有两大企业联盟竞标。一方主张采用欧洲技术，另一方主张采用日本新干线技术。1998年，主张采用欧洲技术标准的台湾高铁联盟取得合约。1999年初，台湾高铁举行了动工典礼。/p>